Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms