Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrphP15331 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrphP15331 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrphP15331 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrphP15331 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrphP15331 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrphP15331 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrphP15331 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrphP15331 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrphP15331 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrphP15331 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms