Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms