Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms