Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms