Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrm1P12657 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms