Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms