Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms