Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms