Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms