Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amd1P0DMN7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amd1P0DMN7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms