Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa6P09092 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms