Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gh1P06880 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gh1P06880 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms