Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnfP06804 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnfP06804 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TnfP06804 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnfP06804 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnfP06804 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnfP06804 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnfP06804 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnfP06804 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnfP06804 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnfP06804 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms