Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms