Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms