Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01821 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01821 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01821 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01821 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01821 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01821 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01821 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01821 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01821 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01821 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01821 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01821 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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