Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01679 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01679 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01679 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01679 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01679 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms