Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01636 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01636 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01636 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01636 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01636 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01636 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01636 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01636 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01636 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms