Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ComtO88587 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ComtO88587 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ComtO88587 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ComtO88587 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ComtO88587 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ComtO88587 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ComtO88587 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ComtO88587 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ComtO88587 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ComtO88587 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ComtO88587 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ComtO88587 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ComtO88587 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ComtO88587 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms