Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dll3O88516 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dll3O88516 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dll3O88516 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dll3O88516 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dll3O88516 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dll3O88516 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dll3O88516 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dll3O88516 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dll3O88516 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dll3O88516 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dll3O88516 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dll3O88516 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dll3O88516 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dll3O88516 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms