Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm10509O88255 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm10509O88255 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm10509O88255 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm10509O88255 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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