Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms