Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms