Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms