Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms