Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SlkO54988 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SlkO54988 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SlkO54988 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SlkO54988 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SlkO54988 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms