Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnk2O54967 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms