Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn5O54942 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn5O54942 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms