Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2f6O54917 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms