Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16O54909 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16O54909 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16O54909 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms