Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms