Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms