Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd2O35927 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms