Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cited2O35740 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cited2O35740 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms