Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clk4O35493 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Clk4O35493 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Clk4O35493 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Clk4O35493 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms