Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms