Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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