Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf5O35326 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms