Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms