Protein–RNA interactions for Protein: O35188

Cx3cl1, Fractalkine, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cl1O35188 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cx3cl1O35188 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cx3cl1O35188 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cx3cl1O35188 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cx3cl1O35188 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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