Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms