Protein–RNA interactions for Protein: O09164

Sod3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod3O09164 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod3O09164 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod3O09164 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod3O09164 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms