Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EllO08856 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EllO08856 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
EllO08856 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EllO08856 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EllO08856 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EllO08856 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EllO08856 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EllO08856 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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