Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms