Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MttpO08601 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MttpO08601 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MttpO08601 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MttpO08601 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms