Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r88L7N1W8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r88L7N1W8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms