Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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Gm21887J3QQ04 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Gm21887J3QQ04 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Gm21887J3QQ04 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Gm21887J3QQ04 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Gm21887J3QQ04 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Gm21887J3QQ04 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Mfap5-207ENSMUST00000148517 1506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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