Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm2056J3QQ02 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm2056J3QQ02 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm2056J3QQ02 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm2056J3QQ02 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm2056J3QQ02 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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