Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms